Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEFLP07196 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEFLP07196 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms