Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRB1P04280 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRB1P04280 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PRB1P04280 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRB1P04280 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms