Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TK1P04183 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TK1P04183 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TK1P04183 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TK1P04183 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TK1P04183 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TK1P04183 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TK1P04183 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TK1P04183 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TK1P04183 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms