Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POP4O95707 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POP4O95707 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POP4O95707 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms