Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GABARAPO95166 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms