Protein–RNA interactions for Protein: O94953

KDM4B, Lysine-specific demethylase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4BO94953 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KDM4BO94953 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms