Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ATG12O94817 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ATG12O94817 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ATG12O94817 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG12O94817 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ATG12O94817 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG12O94817 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ATG12O94817 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ATG12O94817 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ATG12O94817 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG12O94817 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG12O94817 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG12O94817 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG12O94817 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG12O94817 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG12O94817 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG12O94817 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG12O94817 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG12O94817 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG12O94817 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG12O94817 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG12O94817 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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