Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA2O43921 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms