Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTATSF1O43719 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms