Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRPF3O43395 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRPF3O43395 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms