Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RASA4O43374 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RASA4O43374 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RASA4O43374 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASA4O43374 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASA4O43374 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASA4O43374 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RASA4O43374 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms