Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR1CO15160 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms