Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CCSO14618 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CCSO14618 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCSO14618 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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