Protein–RNA interactions for Protein: O00585

CCL21, C-C motif chemokine 21, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21O00585 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL21O00585 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL21O00585 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL21O00585 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL21O00585 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL21O00585 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL21O00585 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL21O00585 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL21O00585 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL21O00585 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL21O00585 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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