Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KPNA3O00505 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms