Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOC4-APOC2K7ER74 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOC4-APOC2K7ER74 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms