Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCER2I3L3R5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms