Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C9orf172C9J069 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms