Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CYSRT1A8MQ03 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms