Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDR42E2A6NKP2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SDR42E2A6NKP2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms