Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GOLGA6CA6NDK9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GOLGA6CA6NDK9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms