Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC144AA2RUR9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC144AA2RUR9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms