Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ARL2-SNX15V9GYD0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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