Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNX8Q9Y5X2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms