Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP16Q9Y5T5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms