Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
KLF12Q9Y4X4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
KLF12Q9Y4X4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms