Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF330Q9Y3S2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms