Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 TTTY14-204ENST00000452584 860 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATF5Q9Y2D1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATF5Q9Y2D1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms