Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SMG5Q9UPR3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMG5Q9UPR3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms