Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TRAPPC2LQ9UL33 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms