Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD3Q9UJU5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms