Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CTNNA3Q9UI47 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CTNNA3Q9UI47 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms