Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP68Q9UHB9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms