Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM5BQ9UGL1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms