Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DUX4Q9UBX2 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms