Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DBF4Q9UBU7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms