Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPASTQ9UBP0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms