Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NLKQ9UBE8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms