Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRP2BPQ9P2M1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRP2BPQ9P2M1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms