Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88CQ9P219 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CCDC88CQ9P219 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CCDC88CQ9P219 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CCDC88CQ9P219 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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CCDC88CQ9P219 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC88CQ9P219 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC88CQ9P219 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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