Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VAPAQ9P0L0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms