Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNIH4Q9P003 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms