Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
EHD3Q9NZN3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EHD3Q9NZN3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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