Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RDH8Q9NYR8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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