Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZDHHC3Q9NYG2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZDHHC3Q9NYG2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms