Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MS4A12Q9NXJ0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms