Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GINM1Q9NU53 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms