Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EMILIN3Q9NT22 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EMILIN3Q9NT22 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms