Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C19orf12Q9NSK7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms