Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAMSN1Q9NSI8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAMSN1Q9NSI8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms